Рассматривается методология проблемы оценки состояния экосистем морей и антропогенного воздействия на них. Основа методологии – изучение функционирования морских экосистем на биогеохимическом уровне. Разработана система интегральных показателей, характеризующих интенсивность экзо- и эндобиогеохимических процессов в морях. Определена интенсивность функционирования экосистем сев. (Белого и Балтийского) и юж. (Каспийского) морей.