Вертикальное распределение организмов зоопланктона имеет важное теоретическое и практическое значение. Оно связано со структурой популяций и биологическими особенностями видов, а также с факторами внешней среды. В результате исследований зоопланктона Телецкого озера было выявлено, что массовые виды этого сообщества распределяются в толще воды в период прямой температурной стратификации по-разному. Основная часть популяций большинства видов концентрируется в теплых слоях воды – слое эпилимниона. Ветвистоусый рачок Arctodiaptomus basillifer предпочитает холодные слои – слой мета- и верхний слой гиполимниона, а рачок Cyclops abyssorum и коловратка Asplanchna priodonta образуют два пика численности и биомассы – в поверхностном горизонте и слое металимниона, причем второй пик менее выражен. Явление избегания зоопланктоном горизонта 0-5 м, характерное для большинства олиготрофных водоемов, в Телецком озере не зарегистрировано. Основные факторы, определяющие характер вертикального распределения массовых видов зоопланктона в Телецком озере – температурный и трофический.